三个月不来月经可通过多种方式治疗，包括检查、药物、手术等。具体如下：
一、检查
若同房时未做好避孕措施而怀孕，可能导致月经不来，此时可前往医院进行抽血HCG和B超检查以判断是否怀孕。怀孕后，女性体内的人绒毛膜促性腺激素（HCG）水平会升高，通过检测血液中的HCG含量，可以较为准确地确定是否怀孕。B超检查则能直观地观察到子宫内是否有孕囊等情况，进一步明确是否怀孕。
二、药物
如果是内分泌紊乱导致三个月不来月经，可在医生指导下服用调经药物进行治疗，比如地屈孕酮片。地屈孕酮片是一种孕激素类药物，可通过调节体内激素水平，促进子宫内膜的增殖和分泌，从而促使月经来潮。它能作用于子宫内膜，使其做好接受受精卵着床的准备，若未受孕，则可引起子宫内膜脱落形成月经。
三、手术
若因物理化学损伤或感染致使子宫颈黏膜粘连，造成子宫颈管狭窄或闭锁而引起月经不来，需遵医嘱及时采取宫颈扩张术或宫颈粘连分离术等方式进行治疗。通过手术操作，将粘连的宫颈黏膜分离开来，恢复宫颈管的通畅，使经血能够正常排出。
三个月不来月经若伴有其他不适症状，还需到医院排除肺结核、肿瘤、甲状腺功能减退等疾病的可能性。总之，当出现三个月不来月经时，应及时就医，明确原因，并根据具体情况选择合适的治疗方法。