骨髓移植捐献者一般出现严重后遗症的情况较少，但可能存在一些相对常见的情况。比如，部分捐献者在捐献后的短期内可能会有一些身体上的不适，像穿刺部位可能会有疼痛，不过这种疼痛大多在几周内会逐渐缓解。
身体方面的短期反应
造血系统相关： 骨髓移植捐献时抽取的是外周血中的造血干细胞，捐献后，身体需要一定时间来恢复造血功能。一般来说，大约1 - 2周内，外周血中的白细胞等血细胞数量可能会有短暂的波动，但大多数人都能逐渐恢复正常。不过少数人可能会出现轻度的血细胞减少，如血小板轻度降低等情况，但通常不需要特殊治疗，会自行恢复。局部穿刺部位情况： 捐献时需要通过采集外周血干细胞的方式，会进行静脉穿刺等操作，穿刺部位可能会有轻微的淤血、疼痛等。通常在1 - 2周内，穿刺部位的淤血会逐渐吸收，疼痛也会消失。
心理方面的影响
情绪波动： 部分捐献者可能会出现心理上的波动。在捐献前可能会有一定的紧张、焦虑情绪，而捐献后也可能会有短暂的担忧，担心自己的身体恢复情况等。大约有10% - 15%的捐献者可能会在捐献后的1 - 3个月内出现轻度的情绪低落等情况，但大多数人能够自行调节过来，只有少数人可能需要心理干预。自我认知变化： 一些捐献者可能会在捐献后对自己的身体有新的认识，觉得自己做了一件很有意义的事，但也可能会有一些担心身体是否会因为捐献而有长期影响的心理负担。
长期健康影响
生育方面： 目前没有明确证据表明骨髓移植捐献会对女性捐献者的生育功能产生长期不良影响。对于男性捐献者，也没有发现骨髓移植捐献会导致生育能力下降等情况。不过从长期随访来看，大部分捐献者的生育功能都是正常的，只有极个别非常特殊的情况可能会有影响，但这种情况非常罕见。免疫系统： 骨髓移植捐献后，捐献者的免疫系统会有一定程度的调整，但一般不会出现严重的免疫缺陷等问题。经过长时间的恢复，免疫系统会逐渐恢复到相对稳定的状态，大多数捐献者的免疫功能都能维持在正常水平，和未捐献过的人在抵御一般疾病方面没有明显差异。