小脚趾甲变黑色的原因包括外伤、营养不良以及疾病因素。具体如下：
一、外伤：
1.脚趾遭受外力撞击或挤压后，会导致甲床内出血，血液淤积进而使脚趾甲发黑。比如干活时脚趾甲被重物击打、活动时脚趾甲不慎碰撞到硬物、剧烈运动时脚趾甲被鞋子挤压等情况。
2.少量淤血通常可自行吸收，而大量淤血则可能需要服用活血化瘀的药物。一般重伤情况下，脚趾甲会在1至2个月内脱落并再生。
二、营养不良：
1.饮食不规律或偏食者，体内缺乏维生素和矿物质时，甲床的营养供给不足，趾甲的新陈代谢出现异常，就可能出现血管挛缩、钙质沉积、色素沉着等情况，从而导致趾甲发黑。
2.通过合理饮食并补充营养后可缓解这种状况。
三、疾病：
1.常见的有甲癣，也就是灰指甲，属于真菌感染。主要表现为趾甲颜色改变，可呈棕色或黑色，同时多伴有趾甲增厚、表面凹凸不平、变脆易碎等症状。
2.可使用特比萘芬片，并配合复方水杨酸乳膏等进行治疗。
总之，当发现小脚趾甲变黑时，要结合自身实际情况，综合判断可能的原因，必要时寻求专业医生的帮助，以便采取合适的应对措施。