小脑萎缩形成的原因较多，遗传因素是其中之一，约有5%-10%的小脑萎缩患者是由遗传因素导致，比如一些常染色体显性或隐性遗传的基因缺陷会引发小脑萎缩。
一、遗传因素相关
某些基因突变： 有特定的基因发生突变时，就可能使得小脑的神经细胞逐渐变性、萎缩。例如一些编码蛋白质的基因出现异常改变，影响了小脑细胞的正常结构和功能，进而导致小脑萎缩的发生。而且遗传相关的小脑萎缩往往有一定的家族聚集性，如果家族中有亲属患有小脑萎缩，那么家族成员患小脑萎缩的风险会相对增高。
二、神经系统疾病相关
多发性硬化： 这是一种中枢神经系统炎性脱髓鞘疾病，当病变累及小脑时，随着病情的进展，可能会引起小脑萎缩。患者除了可能有小脑萎缩的表现外，还会出现肢体无力、视力障碍、感觉异常等多种神经系统症状，病情会逐渐进展，对生活造成较大影响。帕金森病晚期： 帕金森病是一种常见的神经退行性疾病，在疾病的晚期阶段，部分患者会出现小脑萎缩的情况。患者主要表现为运动迟缓、静止性震颤、肌强直等，但到晚期时，小脑也会受到影响而发生萎缩，进一步加重运动协调障碍等问题。
三、其他因素相关
中毒： 长期接触某些有毒物质也可能导致小脑萎缩。比如长期酗酒的人，酒精及其代谢产物会对小脑细胞产生毒性作用，逐渐损伤小脑组织，引发小脑萎缩。还有长期接触重金属如汞、锰等，也可能损害神经系统包括小脑，导致小脑萎缩的发生。慢性酒精中毒： 酒精对小脑的毒性作用是逐渐累积的，长期大量饮酒的人，小脑组织会因为酒精的持续损害而发生萎缩。患者会出现平衡失调、行走不稳、构音障碍等表现，严重影响生活自理能力。