高位截瘫通常是由于脊髓受到严重损伤导致的，治疗较为复杂。目前针对高位截瘫的治疗并没有单一的特效药物能完全治愈，但可以通过多种方法综合干预。一般来说，早期的康复治疗等对改善预后有重要作用。
康复治疗方面
康复训练： 早期就需要进行关节活动度训练，每天至少进行2 - 3次各关节的屈伸活动，防止关节僵硬挛缩。还包括体位变换，每2 - 3小时帮助患者翻身一次，预防压疮。物理治疗： 可以采用低频电刺激等方法，促进肌肉的神经再支配，一般每周进行3 - 5次物理治疗。
药物辅助方面
神经营养药物： 常用的有甲钴胺，它可以促进神经髓鞘的合成，改善神经功能，一般需要长期服用，每日服用剂量根据病情由医生确定。还有鼠神经生长因子，不过它需要肌肉注射，一般每次使用一定剂量，需在医生指导下应用。
并发症预防与治疗方面
泌尿系统并发症： 要预防尿路感染，可让患者每日饮水2000毫升以上，保证尿液的冲刷作用。如果发生尿路感染，可能会使用抗生素，如左氧氟沙星等，但具体用药需根据药敏结果来定。呼吸系统并发症： 预防肺部感染，要帮助患者进行咳嗽咳痰训练，定时拍背，促进痰液排出。如果出现肺部感染，可能会使用头孢类抗生素等进行抗感染治疗，但需遵医嘱。