腺肌症目前常用的药物有非甾体抗炎药等，比如布洛芬，它能在一定程度上缓解腺肌症引起的疼痛，但一般不能从根本上治愈腺肌症，而且通常需要根据个体情况来选择合适药物，并没有绝对意义上“最好”的单一药物。
常用缓解疼痛类药物
非甾体抗炎药：像布洛芬就是常见的非甾体抗炎药，它通过抑制环氧化酶的活性，减少前列腺素合成，从而发挥解热、镇痛、抗炎作用，能缓解腺肌症导致的经期疼痛等症状，一般可以缓解数小时的疼痛不适，但不能根治腺肌症。萘普生：也是非甾体抗炎药的一种，同样通过抑制前列腺素合成来减轻疼痛，对腺肌症引起的疼痛有一定缓解效果，不过使用时也需注意其可能带来的胃肠道等方面的不良反应。
激素类药物情况
孕三烯酮：它是一种人工合成的三烯炔诺酮，是一种雄激素衍生物，具有抗孕激素、抗雌激素和抗性腺效应。它能使异位内膜萎缩、吸收，从而缓解腺肌症相关症状，但长期使用可能会有肝功能损害等风险，需要定期监测肝功能。达那唑：是一种合成雄激素，它能抑制促性腺激素释放激素的分泌，抑制促性腺激素周期高峰，减少卵巢甾体激素的产生，使体内雌激素水平下降，异位内膜萎缩、吸收，可缓解腺肌症症状，但也可能引起体重增加、声音变粗等雄激素样副作用。
其他药物相关情况
GnRH-a类药物：促性腺激素释放激素激动剂，比如亮丙瑞林等。这类药物能抑制垂体分泌促性腺激素，导致卵巢分泌的雌激素水平明显下降，出现暂时性绝经，从而使异位的子宫内膜萎缩，缓解腺肌症引起的经量过多、痛经等症状，但长期使用可能会导致骨质丢失等问题，一般使用时间不超过6个月，需要在医生指导下使用，并同时考虑补充钙剂等防止骨量丢失。中药辅助类：一些中药制剂可能也有一定缓解腺肌症相关症状的作用，比如一些活血化瘀的中药复方，但中药的疗效往往需要更多临床研究来明确，且使用中药也需要在正规中医医师的辨证论治下进行，不能自行随意使用。