早上起来两肩特别疼，可能与以下原因有关：
1.睡姿不良：如果晚上睡觉时长期保持不良姿势，如侧睡时手臂受压、俯卧时肩部直接接触床面等，可能会导致肩部肌肉紧张、血液循环不畅，从而引起疼痛。
2.肩部受凉：晚上睡觉时肩部受凉，如空调直吹、肩部未盖被子等，可能会导致肩部肌肉痉挛，引起疼痛。
3.肩周炎：肩周炎是一种常见的肩部疾病，主要表现为肩部疼痛、活动受限等。肩周炎可在任何年龄发病，但多见于50岁左右的人群，女性多于男性。
4.颈椎病：颈椎病可压迫颈部神经根，导致肩部疼痛、麻木等症状。
5.其他：如肩部外伤、肩部肌肉劳损、肩部肿瘤等，也可引起肩部疼痛。
如果疼痛持续不缓解或伴有其他症状，建议及时就医，明确病因，并进行相应的治疗。同时，在日常生活中，应注意保持良好的睡姿，避免肩部受凉，适当进行肩部运动，如旋转、拉伸等。如果疼痛明显，可在医生的指导下服用非甾体类抗炎药，如布洛芬、扶他林等，缓解疼痛。