脑干出血通常是多种因素共同作用导致的。高血压是引发脑干出血的重要原因之一，据统计，约70% - 80%的脑干出血患者有高血压病史。长期高血压会使脑内小动脉形成微动脉瘤，当血压剧烈波动时，微动脉瘤容易破裂，从而引发脑干出血。
高血压因素
血压控制不佳： 血压长期处于较高水平，比如收缩压持续高于140mmHg，舒张压高于90mmHg，且没有得到有效控制，就会增加脑干出血的风险。血压波动过大： 情绪剧烈波动、过度劳累、寒冷刺激等情况都可能导致血压在短时间内大幅波动，像从正常血压突然飙升到很高的水平，这会对脑血管造成很大冲击，容易引发脑干出血。
血管病变因素
动脉硬化： 随着年龄增长，血管会逐渐发生动脉硬化，血管壁弹性下降、变脆，血液在血管中流动时对血管壁的压力增大，更容易导致血管破裂出血。尤其是本身有高脂血症、糖尿病等基础疾病的人，动脉硬化的发生会更早、更严重。脑血管畸形： 先天性的脑血管畸形，比如动静脉畸形等，血管结构异常，容易出现破裂出血的情况，其中就包括脑干部位的血管畸形，一旦畸形血管破裂，就会引发脑干出血。
其他因素
不良生活习惯： 长期大量吸烟，烟草中的尼古丁等成分会损伤血管内皮，使血管收缩、血压升高，增加脑干出血风险；过度酗酒也会使血压升高，还会影响凝血功能，容易诱发脑干出血。凝血功能异常： 某些血液系统疾病会导致凝血功能出现问题，比如血小板减少性紫癜、血友病等，患者凝血机制异常，即使血压等情况正常，也可能更容易发生脑出血，包括脑干出血。