月经不干净且有褐色的情况，常见疾病包括妇科炎症、多囊卵巢综合征、子宫病变等。可在专科医生指导下，通过使用抗生素及激素治疗，必要时采取手术治疗。具体如下：
一、妇科炎症：
1.阴道炎、子宫内膜炎、盆腔炎等是常见的妇科炎症。炎症刺激可导致阴道出现少量出血现象。
(1)进行抗感染治疗，常用药物如头孢呋辛钠、头孢曲松钠等。
二、多囊卵巢综合征：
1.月经失调是其最主要症状，会表现为不规则子宫出血，月经周期、经期、经量均无规律。
(1)可遵医嘱通过激素进行调经治疗，如戊酸雌二醇、黄体酮等。
三、子宫病变：
1.若存在子宫肌瘤、子宫内膜息肉等情况。
(1)可根据医嘱采取药物或手术治疗。
当女性出现月经总不干净且有褐色时，建议及时就医，完善相关检查，在专科医生的指导下进行针对性治疗。上述药物均需在医生指导下规范使用。
总结提示：月经出现不干净且呈褐色的状况，可能是多种疾病引起，应及时就医检查并明确原因，以便采取合适的治疗措施。