月经走不干净呈褐色可能由多种原因引起。一般来说，正常月经经期为3~7天，如果经期超过7天仍有褐色分泌物，可能是内分泌失调导致，比如多囊卵巢综合征患者约占育龄女性的6%~10%，就可能出现月经淋漓不尽、褐色分泌物的情况；也可能是妇科疾病所致，像子宫内膜炎，有研究显示约10%~15%的女性在生育年龄会患子宫内膜炎；还可能是宫内节育器引起，约有5%~10%放置宫内节育器的女性会出现经期延长、褐色分泌物的情况。
内分泌失调因素
多囊卵巢综合征：除了月经走不干净呈褐色外，还常伴有月经稀发、肥胖，体重超过正常范围10%~20%的多囊患者较多见，同时可能有多毛等表现。患者需调整生活方式，比如每周至少进行150分钟的中等强度有氧运动。黄体功能不足：黄体萎缩不全导致子宫内膜不能及时完整脱落，会使月经经期延长出现褐色分泌物。一般这类患者基础体温双相，但高温相持续时间短，约9~10天。
妇科疾病因素
子宫内膜炎：除了月经异常外，还可能有下腹部疼痛，尤其是在性生活后或月经期间疼痛加重，阴道分泌物增多且有异味。进行妇科检查时，子宫有压痛。子宫肌瘤：黏膜下子宫肌瘤容易导致月经淋漓不尽，呈褐色。肌瘤较小时可能无明显症状，较大的肌瘤可通过B超发现，B超下能看到子宫肌层内异常回声团。
宫内节育器因素
放置宫内节育器后，身体需要一定时间适应，在适应期内约有5%~10%的女性会出现经期延长、经量增多或褐色分泌物等情况。如果适应3~6个月后仍持续出现月经走不干净褐色的情况，可能需要考虑更换节育器或采取其他避孕措施。