一般而言，功能性消化不良能否自愈需依患者病情来分析。若病情较轻，通常可自愈；反之则难以自愈。具体如下：
一、能自愈的情况
功能性消化不良多由饮食因素、不良生活习惯等引发。如果病情较轻，未出现明显器质性病变，且患者养成良好的饮食与生活习惯，那么通常是能够自愈的。比如患者合理调整饮食结构，避免暴饮暴食，减少辛辣、油腻、刺激性食物的摄入；同时保持规律作息，不熬夜，适度运动，保持心情舒畅等，都可能促使病情好转乃至自愈。
二、不能自愈的情况
要是患者病情较为严重，已发生器质性病变，如导致慢性胃炎、胃食管反流等。患者有明显的腹胀、反酸、嗳气、呕吐、恶心等不适症状，通常就无法自愈了。这时需要在医生指导下使用药物进行治疗，常用药物有雷贝拉唑钠肠溶片、泮托拉唑肠溶片、雷贝拉唑钠肠溶片等。在治疗期间，患者要避免暴饮暴食或进食油腻刺激性食物，以防加重病情。
总之，对于功能性消化不良患者，应根据具体病情判断能否自愈，病情严重时需积极配合治疗并注意相关饮食禁忌。