药流后二十天仍然有褐色分泌物，可能是以下原因导致：
1.药流不全：药流后子宫内有残留的胚胎组织，会导致阴道出血时间延长，出现褐色分泌物。需要进行B超检查，确认子宫内是否有残留，如果有残留，需要进行清宫手术。
2.子宫内膜修复不良：药流可能会对子宫内膜造成一定的损伤，导致子宫内膜修复不良，出现褐色分泌物。可以使用促进子宫收缩的药物，如益母草、新生化颗粒等，帮助子宫收缩，促进子宫内膜修复。
3.感染：药流后如果不注意个人卫生，容易导致细菌感染，引起子宫内膜炎、盆腔炎等，出现褐色分泌物，并伴有腹痛、发热等症状。需要进行抗感染治疗，使用抗生素，如头孢呋辛酯、甲硝唑等。
4.内分泌失调：药流后体内激素水平发生变化，可能导致内分泌失调，引起月经紊乱，出现褐色分泌物。可以进行激素六项检查，根据检查结果进行调理。
5.其他：药流后过度劳累、精神紧张、压力过大等，也可能导致褐色分泌物持续时间延长。需要注意休息，保持心情舒畅，避免过度劳累和精神紧张。
需要注意的是，药流后出现褐色分泌物应及时就医，进行相关检查，明确原因，并在医生的指导下进行治疗。同时，药流后要注意个人卫生，保持外阴清洁，一个月内禁止性生活和盆浴，避免感染。