发烧过后全身酸痛不退烧也疼，多是因为发烧时身体代谢加快，产生了如乳酸等代谢产物堆积，刺激神经所致。一般这种全身酸痛会在1~2周内逐渐缓解，但也有个体差异。
肌肉损伤方面的原因
运动代谢产物堆积：发烧时身体处于应激状态，代谢率升高，肌肉无氧酵解增加，产生大量乳酸。当乳酸堆积在肌肉中，就会刺激神经末梢，引起酸痛感。比如人在剧烈运动后也会因乳酸堆积肌肉酸痛，发烧后的情况类似，只是诱因是发烧这个全身性的应激反应。肌纤维微小损伤：发烧可能会导致肌纤维出现微小的损伤，虽然肉眼看不到，但身体会启动修复机制，在修复过程中会引发炎症反应，进而带来酸痛感。
炎症反应导致
免疫系统激活：发烧通常是身体免疫系统在对抗感染时的表现，免疫系统激活后会释放一些炎症介质，像前列腺素等。这些炎症介质会作用于神经末梢，让人体感觉到酸痛，而且即使不发烧了，炎症介质的残留效应还可能持续一段时间导致疼痛。关节周围炎症：如果是感染累及关节周围组织，比如病毒感染引发的关节炎等情况，即使体温恢复正常，关节周围的炎症依然存在，就会持续出现全身酸痛，尤其是关节相关部位更明显。
身体疲劳因素
能量消耗过度：发烧时身体消耗大量能量，身体处于疲劳状态。肌肉在疲劳状态下，对乳酸等代谢产物的清除能力下降，更容易堆积，从而加重酸痛感。就像长时间高强度劳动后身体会疲劳酸痛一样，发烧后身体也是处于类似的疲劳状态。恢复需要时间：身体在发烧后需要时间来恢复正常的代谢和生理功能，包括清除堆积的代谢产物、修复肌纤维损伤等。这个恢复过程可能需要1周甚至更久，所以在恢复期间会持续有全身酸痛的感觉。