新生儿湿疹的发生通常与多种因素相关。一般来说，约60%的新生儿湿疹与遗传因素有关，如果父母一方有过敏性疾病史，如哮喘、过敏性鼻炎等，新生儿患湿疹的概率会明显增加。
遗传因素影响
家族过敏史关联： 如果家族中有长辈患有过敏性疾病，像父母一方有过敏性鼻炎或者哮喘，那么新生儿发生湿疹的可能性就会升高。因为遗传基因会使新生儿的皮肤屏障功能更容易出现异常，从而增加湿疹发病风险。
皮肤屏障功能不完善
皮肤特点决定： 新生儿的皮肤非常薄嫩，角质层发育还不完善，皮肤的保水能力比较差。正常情况下，皮肤可以起到阻挡外界刺激物和过敏原的作用，但新生儿的皮肤屏障功能弱，外界的一些物理刺激，比如衣物的摩擦，或者一些化学物质的刺激，都容易引发湿疹。而且新生儿皮肤的pH值与成人不同，也会影响皮肤的自身保护功能。
过敏因素诱发
食物过敏可能： 对于母乳喂养的新生儿，母亲饮食中的某些食物可能通过乳汁传递给新生儿，引发过敏反应从而导致湿疹。比如母亲吃了鱼虾、牛奶等易过敏食物，就可能诱发新生儿湿疹。对于配方奶喂养的新生儿，奶粉中的蛋白质也可能成为过敏原，引起湿疹。据统计，约有30%的婴儿湿疹与食物过敏有关。环境过敏原影响： 新生儿所处的环境中的过敏原也可能诱发湿疹。例如室内的尘螨、花粉等，尘螨的排泄物微小颗粒会附着在新生儿的衣物、被褥上，新生儿接触后就可能引发皮肤的过敏反应，出现湿疹症状。还有一些毛绒玩具上的绒毛，也可能成为过敏原刺激新生儿皮肤。