引起小便疼痛的原因包括泌尿系统感染、泌尿系统结石、泌尿系统外伤以及导尿治疗后等，需根据具体原因进行合理治疗。
一、泌尿系统感染：当有细菌感染尿道时，会使尿道黏膜出现充血水肿甚至损伤。在上厕所时，尿液流经受损的尿道黏膜就会产生刺痛感。对此，首先可通过大量饮水来增加尿量，排尿时可冲洗尿道分泌物。同时还能依据细菌培养和药敏试验来选择有效的抗生素进行抗菌治疗。
二、泌尿系统结石：由于结石阻碍了尿道，在小便时会有刺痛感，还可能伴有排尿困难、尿分叉等情况。对于结石较小且无明显嵌顿的，可以大量饮水，并进行跳跃动作，这样有利于结石排出。若合并感染可应用敏感抗菌药物。而当结石引起梗阻影响排尿，或经非手术治疗无效时，则应考虑手术内镜下碎石或取石。
三、泌尿系统外伤：这些外伤可能会导致尿道黏膜受损，从而出现血尿或排尿刺痛。一般较小的挫伤，患者只需多喝水并口服抗生素预防感染即可。但若尿道部分裂伤致使患者排尿困难，则通常可采用留置导尿管进行治疗。
四、导尿治疗后：在行导尿治疗后拔除导尿管时，前几次小便也会出现刺痛，这种情况无需特殊治疗，病人多喝水，随着排尿次数的增加，刺痛会逐渐缓解直至消失。
总之，对于小便疼痛的情况，要明确其具体原因，然后采取针对性的措施进行治疗，以缓解不适症状。