肠结核是由结核分枝杆菌引起的肠道慢性特异性感染，其症状表现多样。一般来说，约半数以上的患者会出现腹痛症状，多为右下腹或脐周隐痛，有时呈绞痛，进食后加重，排便后可缓解。
消化道症状表现
腹痛： 多数患者有右下腹疼痛，疼痛性质多样，可为隐痛、钝痛或痉挛性痛，进食可诱发或加重，排便后可缓解。部分患者腹痛与胃肠功能紊乱有关。腹泻与便秘： 腹泻是肠结核常见症状之一，粪便多呈糊样，一般每日2 - 4次，重者可达每日10余次。有时患者会出现腹泻与便秘交替的情况，这是因为病变引起肠道功能紊乱，当溃疡型肠结核时，肠道吸收功能障碍，导致腹泻；而增生型肠结核多以便秘为主要表现。
全身症状表现
发热： 患者常出现午后低热，体温一般在37.5℃ - 38.5℃之间，部分患者可伴有夜间盗汗。这是由于结核分枝杆菌感染后，机体产生免疫反应，导致体温调节中枢功能紊乱引起的。乏力、消瘦、贫血： 长期慢性消耗，患者会出现乏力、消瘦等表现，体重可逐渐下降。由于肠道吸收不良及结核毒素的影响，部分患者还可能出现贫血，表现为面色苍白、头晕等。
腹部体征表现
腹部压痛： 右下腹常有固定性轻压痛，压痛点比较局限。这是因为病变主要累及右下腹肠道。腹部肿块： 增生型肠结核可触及腹部肿块，质地中等，比较固定，伴有轻至中度压痛。肿块多位于右下腹，是由于肠壁增厚、粘连或形成炎性包块所致。而溃疡型肠结核一般较少触及腹部肿块，若有肿块，多为病变肠段和周围组织粘连形成。