肠结核是由结核分枝杆菌引起的肠道慢性特异性感染，其症状表现多样。一般来说，肠结核常见的症状有腹痛、腹泻与便秘交替、全身症状等。
腹痛表现
腹部隐痛或钝痛： 多数患者会出现右下腹隐痛或钝痛，这是因为肠结核好发于回盲部。疼痛多在进食后诱发，排便后可有所缓解。不过，也有部分患者疼痛部位不固定。疼痛性质与程度： 疼痛程度一般较轻，呈间歇性发作，但如果病情加重，可能会出现较剧烈的绞痛。
腹泻与便秘交替情况
腹泻为主： 在肠结核早期，肠道功能紊乱，可能以腹泻为主要表现。粪便多为糊状，一般无脓血，每天排便次数大概2 - 4次左右。如果病变累及结肠，也可能出现黏液脓血便，但相对较少见。便秘为主： 随着病情发展，部分患者会出现便秘情况，这是因为肠管狭窄或梗阻等原因，导致大便排出困难。此时腹泻与便秘可能会交替出现。
全身症状体现
发热： 多数患者有午后低热，体温一般在37.5 - 38℃左右，部分患者可出现弛张热或稽留热。发热可持续数周或数月，伴有盗汗等症状。消瘦、乏力： 由于结核分枝杆菌感染是慢性消耗性疾病，患者会出现消瘦、乏力等全身消耗症状。体重会逐渐下降，精神状态也会变差，活动耐力明显降低。
其他表现
腹部肿块： 部分患者可在右下腹触及肿块，质地中等，比较固定，伴有轻至中度压痛。这是因为肠粘连或增生型肠结核导致局部组织增厚形成肿块。肠梗阻表现： 多见于增生型肠结核，患者会出现腹胀、腹痛加剧、呕吐、停止排气排便等肠梗阻症状，这是由于肠腔狭窄或梗阻引起的。