治疗HPV的药物主要有重组人干扰素α-2b凝胶等。一般来说，重组人干扰素α-2b凝胶可用于治疗HPV感染，它通过调节免疫功能等发挥作用，部分患者使用后可促使HPV转阴，但效果因个体差异有所不同。
干扰素类药物
重组人干扰素α-2b凝胶： 它可以调节人体的免疫功能，增强机体对HPV的清除能力。通常需要连续使用一段时间，比如每天睡前清洁外阴后将凝胶涂抹于阴道深部等合适部位。不过，使用时要注意，对干扰素过敏者禁用。重组人干扰素α-1b注射液： 也能参与机体的免疫调节过程，在一定程度上帮助机体对抗HPV感染。但使用该药物可能会出现一些不良反应，像发热、头痛等，若出现严重不良反应应及时就医。
其他抗病毒药物
更昔洛韦： 属于核苷类抗病毒药物，能抑制病毒DNA的合成。不过，它主要不是专门针对HPV的一线药物，但在一些合并其他病毒感染的情况下可能会用到。使用时要注意监测血常规等指标，因为它可能会对骨髓造血功能有一定影响。阿昔洛韦： 同样是抗病毒药物，对部分病毒有抑制作用。对于HPV感染，它不是常规的首选药物，但在特定的医疗场景下可能会根据病情使用。使用该药物时要注意多喝水，促进药物排泄，肾功能不全者要谨慎使用。
生物制剂类
抗HPV生物蛋白敷料： 这类敷料可以在病变部位形成保护膜，起到隔离病毒等作用，帮助机体自身清除HPV。使用时按照产品说明进行操作，一般需要将敷料放置在阴道等相应部位。使用前要注意清洁局部，保证操作的卫生。需要注意的是，HPV感染后是否需要用药以及具体用哪种药，都需要医生根据患者的具体情况来判断，比如HPV感染的分型、患者的年龄、有无症状等。而且，大部分HPV感染是可以依靠自身免疫力清除的，只有少部分持续感染的患者可能需要药物辅助治疗。