直肠炎的治疗药物需根据病因选择，一般来说，常见的治疗药物有美沙拉嗪等氨基水杨酸制剂，通常需要连续使用一段时间来控制炎症。比如轻中度的溃疡性直肠炎，常用美沙拉嗪栓剂，可能需要使用数周甚至数月来缓解症状。
氨基水杨酸制剂类药物
美沙拉嗪：这类药物能抑制肠道炎症反应，对轻中度的直肠炎有较好的疗效。它可以通过局部作用于直肠黏膜，减轻炎症、充血、水肿等症状。例如，美沙拉嗪栓剂直接作用于直肠病变部位，能针对性地缓解直肠炎引起的不适。柳氮磺吡啶：也是氨基水杨酸制剂的一种，它在肠道内分解为5-氨基水杨酸和磺胺吡啶，其中5-氨基水杨酸发挥抗炎作用，用于治疗直肠炎，但部分患者可能会出现过敏等不良反应。
糖皮质激素类药物
氢化可的松：对于病情较重的直肠炎患者，可能会使用糖皮质激素类药物。氢化可的松可以通过全身或局部用药来迅速减轻炎症反应。比如直肠给药的氢化可的松制剂，能快速缓解直肠的炎症症状，但长期使用可能会有一些副作用，如导致肠道菌群失调等，所以一般在病情急性期短期使用。泼尼松：口服的糖皮质激素，在直肠炎病情较为严重时，可短时间口服使用，能有效控制炎症，但需注意其可能引起的如骨质疏松、血糖升高等副作用，使用时需在医生严密监测下进行。
益生菌类药物
双歧杆菌四联活菌片：直肠炎患者常伴有肠道菌群失调，补充益生菌有助于调节肠道菌群。双歧杆菌四联活菌片含有双歧杆菌等有益菌，能改善肠道微生态环境，增强肠道屏障功能，辅助直肠炎的治疗。枯草杆菌二联活菌颗粒：同样是调节肠道菌群的药物，它可以补充肠道有益菌，抑制有害菌的生长，对于直肠炎引起的肠道功能紊乱有一定的调节作用，适合长期辅助治疗来改善肠道状态。