阴道厌氧菌感染时，常见症状有阴道分泌物异常，大约有10% - 40%的患者会出现阴道分泌物增多的情况，且分泌物多有异常气味，典型的是散发恶臭味。
阴道分泌物方面的症状
分泌物增多： 阴道厌氧菌感染会使阴道内菌群失衡，导致分泌物量较平时明显增多。分泌物的质地可能呈现稀薄状，与正常的阴道分泌物有明显区别。异味明显： 厌氧菌在阴道内繁殖过程中会产生一些特殊的代谢产物，从而让阴道分泌物散发出恶臭味，这种气味比较容易被察觉，一旦出现需引起重视。
局部不适症状
瘙痒感： 阴道厌氧菌感染可能会刺激阴道黏膜，引起不同程度的瘙痒，瘙痒程度因人而异，有的患者可能只是轻微瘙痒，而有的患者瘙痒感较为强烈，会忍不住搔抓外阴，但过度搔抓可能会导致外阴皮肤破损等情况。灼热感： 阴道局部会有灼热不适的感觉，尤其是在排尿时，尿液刺激阴道局部，灼热感可能会更加明显。
全身相关症状
发热情况： 一般来说，单纯的阴道厌氧菌轻度感染可能不会引起全身发热，但如果感染比较严重，细菌产生的毒素等可能会引起机体的全身反应，部分患者可能会出现低热，体温在37.5℃ - 38℃左右，不过这种全身发热的情况相对较少见。乏力表现： 由于感染带来的身体不适，患者可能会感觉全身乏力，没有精神，做事情提不起劲，影响日常生活和工作状态。