患有扁桃体炎时，常用的药物有抗生素类和对症治疗药物等。一般来说，细菌感染引起的扁桃体炎常用抗生素，比如青霉素类抗生素，若是对青霉素过敏，可选用头孢类等抗生素。
抗生素类药物
青霉素类： 如果是细菌感染导致的扁桃体炎，青霉素是常用药物之一。它通过抑制细菌细胞壁的合成发挥杀菌作用，对多种细菌有较好的抗菌活性。一般来说，对于敏感菌引起的轻度扁桃体炎，可使用青霉素类药物。头孢类抗生素： 头孢菌素类药物也是治疗扁桃体炎常用的抗生素。例如头孢氨苄等，这类药物抗菌谱较广，对多种革兰阳性菌和革兰阴性菌都有作用。不过使用头孢类药物前要确认患者没有头孢类药物过敏史。
对症治疗药物
解热镇痛药： 当扁桃体炎患者出现发热、咽痛较明显时，可使用解热镇痛药，如对乙酰氨基酚。它能通过抑制前列腺素的合成，起到解热、镇痛的作用，一般服用后0.5 - 1小时左右开始起效，能缓解发热和咽痛症状。糖皮质激素： 在一些病情较重的扁桃体炎中，如存在高热不退等情况，可能会短期使用糖皮质激素，如地塞米松。但糖皮质激素使用有严格的适应症和剂量要求，需在医生评估后使用。
局部用药
含漱液： 可以使用复方硼砂含漱液，它有消毒防腐的作用，能清洁口腔、减轻扁桃体炎引起的咽部不适。使用时取适量含漱液，每日数次，含漱后吐出。含片： 比如度米芬含片，含服后可以直接作用于咽部局部，起到杀菌、消炎的作用，缓解扁桃体炎带来的咽痛等症状。
注意事项
对于儿童扁桃体炎患者，使用药物要特别谨慎。儿童的肝肾功能还未发育完全，在选择抗生素等药物时要考虑药物对儿童的影响。同时，无论是哪种药物治疗，都要按照医生的建议使用，不能自行增减药量。如果扁桃体炎反复发作，可能需要考虑手术治疗等其他方式，而不是单纯依赖药物治疗。