金花清感和连花清瘟主要有两方面区别，一是主要成分不同，二是针对疾病的程度不同。金花清感与连花清瘟都是用于治疗风热感冒、肺热感冒及流感的药物，它们的主要成分都选取了张仲景《伤寒论》麻杏石甘汤和吴鞠通《温病条辨》银翘散中的主要药物，相同的有金银花、石膏、连翘、麻黄、苦杏仁、甘草和薄荷。而主要区别在于连花清瘟应用了大黄、藿香和红景天。
一、大黄：具有通腑泄肺的作用。因为肺与大肠相表里，能让肺热从大便排出，使邪有出路。其另一重要价值是先证用药，能够截断病势。
二、藿香：可芳香化湿、避秽化浊，能改善食欲不振、湿困脾胃的状况。
三、红景天：具有补肺平喘活血的功效，能够提高人体抗疲劳、耐缺氧能力，还能改善患者淋巴细胞及亚群偏低造成的机体抗病能力下降，提升机体的抗病康复能力及免疫力。
所以，虽然两种药都能治疗风热感冒，但金花清感主要用于轻症的治疗，而连花清瘟对于轻症和重症，以及感冒和流感都有很好的效果，尤其是在用于“热毒袭肺”证候时，效果更为显著。
总结概况提示：金花清感和连花清瘟的区别在于成分和适用疾病程度，连花清瘟因含特殊成分在多种病症上效果更优。