扁平尤治疗方法较多，一般可通过药物治疗、物理治疗等方式，其中药物治疗里常用的有维A酸类药物等，不过具体效果因个体差异而异。
药物治疗方面
外用药物： 维A酸类药物是常用的，像维A酸乳膏，它可以调节表皮细胞的分化，对扁平尤有一定的治疗作用，但使用时要注意可能会有局部刺激反应，比如皮肤发红、脱屑等情况。还有5%咪喹莫特乳膏，它能调节局部免疫反应来发挥作用，但使用后可能会出现局部红斑、水肿等不良反应。内用药物： 对于病情较严重的患者，可能会用到免疫调节剂，如转移因子口服溶液等，它可以增强机体的免疫功能来帮助清除扁平尤，但具体效果因人而异，而且使用时要注意可能会有一些轻微的不适，比如头痛等。
物理治疗方面
冷冻治疗： 利用低温使扁平尤组织坏死脱落。一般需要多次治疗，每次治疗间隔大概2-3周。治疗后局部会出现水疱、结痂，然后脱落，治疗过程中可能会有疼痛感觉，不过大多数人可以耐受。激光治疗： 用激光的能量去除扁平尤组织。治疗相对比较快捷，但是术后要注意保持局部清洁，避免感染，可能会留下短暂的色素沉着，一般在数月后可逐渐消退。电灼治疗： 通过电流的高温破坏扁平尤组织。治疗时会有一定的疼痛感，术后要注意创面护理，防止感染，也可能会有结痂和脱痂的过程。
日常注意事项方面
避免搔抓： 扁平尤具有传染性，搔抓可能会导致自身接种，使皮疹增多。所以要尽量克制自己不要去搔抓患处，防止病情扩散。注意皮肤清洁： 保持皮肤的清洁卫生，但是要注意清洁时不要过度用力，避免损伤皮肤，引发新的皮疹。增强免疫力： 平时要注意合理作息，保证充足的睡眠，一般建议成年人每天睡眠7-8小时左右，同时要均衡饮食，多摄入富含维生素和蛋白质的食物，像新鲜的蔬菜、水果、瘦肉等，这样有助于增强机体免疫力，对扁平尤的恢复有一定帮助。