智齿旁边的肉疼可能涉及多种因素，要依据具体原因实施相应治疗。首先可能是吃了坚硬食物使智齿旁边的肉受刺激导致，通常停止进食一段时间后可自行缓解，无需特殊处理。此外，还可能和智齿冠周炎、牙龈炎、牙周炎等有关，需明确病因后予以治疗。
一、智齿冠周炎：多见于智齿萌出过程中以及阻生智齿，属于智齿牙冠周围软组织的炎症，一般由细菌感染、智齿萌出不足引起，表现为牙冠软组织疼痛、肿胀以及吞咽困难等，从而出现智齿旁边的肉疼。如果处于急性期，需及时就医，局部要用生理盐水等进行冲洗，应用碘甘油等进行治疗，要是存在脓肿，还需切开引流，要遵医嘱应用甲硝唑、克林霉素等药物进行治疗，等病情稳定后应尽早拔除智齿，以免复发。
二、牙龈炎：若患者患有牙龈炎，也会出现智齿旁边的肉疼，同时伴有牙龈充血、水肿以及糜烂等情况。需要先去除局部牙菌斑、牙结石，然后遵医嘱服用甲硝唑等药物进行治疗，若疗效不好，或存在牙龈纤维增生明显等状况，则要及时进行手术治疗。
三、牙周炎：牙周炎通常与牙菌斑、牙结石附着在牙齿表面有关，会导致患者智齿旁边的肉疼，还伴有口臭、牙龈出血、牙齿松动等症状。牙周炎的治疗需要在进行洁治、刮治及根面平整术等牙周基础治疗后，在医生指导下服用罗红霉素、阿莫西林等药物，若疗效不佳或病情较重，比如出现牙周袋、牙槽骨吸收等情况，则要及时进行翻瓣术、植骨术等手术治疗。
总之，智齿旁边肉疼的原因多样，应根据具体情况进行诊断和治疗，以缓解疼痛和解决相关问题。