乙肝小三阳有一定比例可以实现病毒转阴，但不是全部。一般来说，通过规范治疗，部分患者可达到病毒学应答等情况。
治疗的主要方式
抗病毒治疗方面
干扰素治疗： 普通干扰素需要每周皮下注射3次，疗程一般为1年左右，但部分乙肝小三阳患者使用后可能有一定效果，不过不良反应相对较多，像发热、流感样症状等较为常见。聚乙二醇干扰素每周注射1次，相比普通干扰素，用药更方便些，但费用相对较高。核苷酸类似物： 常见的有恩替卡韦和替诺福韦等。恩替卡韦需要每天口服1片，长期服用可抑制乙肝病毒复制，随着用药时间延长，部分患者病毒可转阴，但需要长期坚持用药。替诺福韦也是每天口服1次，抗病毒效果较好，耐药率低，同样需要长期服用来维持病毒抑制状态。
影响转阴的因素
病毒因素
病毒基因型： 如果是B基因型的乙肝小三阳患者，对某些抗病毒药物的应答可能相对较好，而C基因型的患者可能在治疗反应上有差异。一般B基因型患者使用核苷酸类似物治疗效果相对更理想些。病毒载量： 乙肝小三阳患者体内病毒载量较低时，相对来说治疗更容易取得病毒转阴的效果。通常病毒载量低于10^5拷贝/毫升的患者，在规范治疗下病毒转阴的概率可能相对高一些。
患者自身因素
年龄： 年轻患者（一般指年龄在18-40岁左右）自身免疫状态相对较好，在接受抗病毒治疗时，可能更有利于病毒的控制和转阴。而年龄较大的患者（如50岁以上），身体机能下降，免疫反应相对较弱，病毒转阴的难度可能会增加。是否合并其他疾病： 如果乙肝小三阳患者同时合并有糖尿病、脂肪肝等疾病，会影响治疗效果，进而影响病毒转阴。比如合并脂肪肝的患者，肝脏脂肪变性会干扰药物在肝脏的代谢，可能降低抗病毒药物的疗效，使得病毒转阴更困难。
日常注意事项对转阴的影响
饮食方面
合理膳食： 乙肝小三阳患者要保证均衡饮食，多吃富含蛋白质的食物，像鸡蛋、牛奶、鱼肉等，每天蛋白质摄入量可维持在1-1.5克/千克体重，有助于修复受损肝细胞，辅助病情恢复，利于病毒转阴。同时要控制脂肪摄入，避免食用过多油腻食物，如油炸食品等，防止加重肝脏负担。避免饮酒： 酒精对肝脏的损害极大，乙肝小三阳患者必须绝对戒酒。因为酒精进入人体后90%要在肝脏代谢，会加重肝脏炎症坏死，影响抗病毒治疗效果，阻碍病毒转阴进程。
生活作息方面
充足睡眠： 保证每天7-8小时的高质量睡眠，有利于肝脏的自我修复和代谢。夜间11点到凌晨1点是肝脏排毒的黄金时间，此时进入深度睡眠状态，能让肝脏更好地进行代谢和修复，对病情恢复及病毒转阴有积极作用。适度运动： 适当进行有氧运动，如快走、慢跑等，每周运动3-5次，每次30分钟左右。运动可以增强体质，提高免疫力，促进血液循环，帮助肝脏更好地发挥功能，辅助病情改善，利于病毒转阴，但要注意避免过度劳累。