甲状腺腺瘤的治疗方式需根据具体情况而定。一般来说，手术切除是主要的治疗手段，约95%以上的甲状腺腺瘤需要通过手术来处理。
手术治疗情况
单发甲状腺腺瘤： 对于单发的甲状腺腺瘤，通常会采用甲状腺腺瘤切除术。手术可以完整切除腺瘤，解除对周围组织的可能压迫等影响。一般手术创伤相对可控，术后恢复情况较好。多发甲状腺腺瘤且有压迫症状： 如果是多发的甲状腺腺瘤并且已经出现压迫气管、食管等导致呼吸困难、吞咽困难等症状时，也需要考虑手术治疗，通过手术去除腺瘤缓解压迫情况。
观察随访情况
小的良性甲状腺腺瘤： 对于一些体积较小、没有明显症状且经评估为良性倾向的甲状腺腺瘤，可以选择定期观察随访。一般建议每隔3 - 6个月进行一次甲状腺超声检查，观察腺瘤的大小、形态等变化情况。如果在观察期间腺瘤没有明显变化，可继续随访；若有增大趋势则考虑手术。老年患者或身体状况差不宜手术： 对于一些年龄较大、身体状况较差不能耐受手术的患者，也可以考虑定期观察随访，但需要密切关注腺瘤的情况，因为存在一定恶变可能，一旦有异常变化要及时调整治疗方案。
药物治疗情况
一般不首选药物治疗： 目前对于甲状腺腺瘤并没有特效的药物能使其消除。一些抑制甲状腺激素的药物等并不能从根本上治疗甲状腺腺瘤。不过，如果甲状腺腺瘤患者伴有甲状腺功能异常，如合并甲亢时，可能会根据情况使用抗甲状腺药物来暂时控制甲状腺功能亢进的症状，但这只是对症处理，不能使腺瘤消失，仍需要后续针对腺瘤本身考虑手术等治疗。例如合并甲亢时可能会用到甲巯咪唑等抗甲状腺药物，但药物治疗不能替代针对腺瘤的最终处理。