脑膜炎后遗症的症状较多，常见的有认知障碍，约有30%左右的脑膜炎患者会出现不同程度的认知问题，比如记忆力减退、注意力不集中等。
神经系统方面的症状
运动功能障碍：部分患者会出现肢体瘫痪的情况，若病变影响到肢体运动相关的神经传导通路，就可能导致一侧或双侧肢体无力，严重的甚至无法正常行走。还有些患者会有不自主运动，像手足徐动症，表现为肢体缓慢、无目的的扭曲运动。癫痫发作：大约10% - 20%的脑膜炎患者会遗留癫痫后遗症。患者会出现突然的肢体抽搐、意识丧失等症状，发作形式多样，有的是全身性大发作，表现为四肢抽搐、口吐白沫；有的是部分性发作，仅表现为身体某一局部的抽动。
精神心理方面的症状
情绪障碍：很多患者会出现抑郁症状，表现为情绪低落、对事物缺乏兴趣、自我评价低等，严重的可能有自杀倾向。也有部分患者会出现焦虑症状，表现为过度紧张、担心、坐立不安等。智力减退：对于一些病情较重、治疗不及时的患者，可能会出现智力减退的情况，表现为学习能力下降、理解能力变差等，严重影响日常生活和社会功能。
其他方面的症状
视力听力问题：如果脑膜炎影响到视神经或听神经，患者可能出现视力下降、视野缺损甚至失明，或者听力减退、耳鸣等症状。比如病变累及视神经时，患者看东西模糊不清，严重时视力完全丧失。内分泌紊乱：部分患者可能出现内分泌方面的问题，如垂体功能受损，导致激素分泌异常，可能出现生长发育迟缓（多见于儿童患者）、性腺功能减退（表现为月经不调、性功能障碍等）、甲状腺功能减退（出现乏力、怕冷、水肿等症状）等。