药流后第三天小腹坠痛，可能是以下原因引起：
1.子宫收缩：药流后，子宫会通过收缩来排出剩余的组织和血块，这可能会导致小腹坠痛。这种疼痛通常是阵发性的，且在药流后的几天内逐渐减轻。如果疼痛不严重，可以通过休息、热敷等方式缓解。
2.感染：药流可能会引起子宫内膜炎、盆腔炎等感染，导致小腹坠痛、发热、阴道分泌物异常等症状。如果出现这些症状，需要及时就医，进行抗感染治疗。
3.残留组织：药流后，如果子宫内有残留的组织，也可能会导致小腹坠痛。需要进行B超检查，确定是否有残留组织，如果有，需要进行清宫手术。
4.其他：药流后，身体需要一定的时间恢复，如果过度劳累、着凉等，也可能会导致小腹坠痛。
如果药流后第三天小腹坠痛严重，或伴有发热、阴道大量出血等症状，应及时就医，以便明确病因，并进行相应的治疗。同时，药流后应注意休息，避免劳累和着凉，保持会阴部清洁，一个月内禁止性生活和盆浴。