贲门炎的治疗药物选择需根据具体病情来定，一般常用抑制胃酸分泌的药物，比如质子泵抑制剂中的奥美拉唑，它能有效减少胃酸分泌，缓解贲门炎引起的不适，通常能在一定程度上改善症状，但具体效果因个体差异而异。
抑制胃酸分泌药物
质子泵抑制剂：像奥美拉唑，它通过抑制胃壁细胞上的质子泵，从而减少胃酸分泌，能有效缓解贲门炎导致的烧心、反酸等症状。H2受体拮抗剂：例如雷尼替丁，它可以竞争性阻断组胺H2受体，减少胃酸分泌，对贲门炎引起的不适有一定的缓解作用，但相对质子泵抑制剂作用稍弱。
保护胃黏膜药物
铝碳酸镁：它能迅速中和胃酸，并且在胃黏膜表面形成一层保护屏障，覆盖在贲门受损的黏膜处，减轻胃酸、胆汁等对黏膜的刺激，促进黏膜修复。硫糖铝：服用后在胃内可形成保护膜，附着于贲门炎症部位，防止胃酸等进一步损伤黏膜，有助于黏膜的修复和炎症的消退。
针对病因治疗药物
如果是幽门螺杆菌感染引起的贲门炎：则需要进行抗幽门螺杆菌治疗，通常采用三联疗法（质子泵抑制剂+两种抗生素）或四联疗法（质子泵抑制剂+铋剂+两种抗生素），比如常用的阿莫西林联合克拉霉素加上奥美拉唑等药物组合来杀灭幽门螺杆菌，从病因上治疗贲门炎。如果是胆汁反流导致的贲门炎：可以使用促进胃肠动力的药物，如多潘立酮，它能增强胃肠蠕动，减少胆汁反流至贲门部位，从而减轻对贲门黏膜的刺激，缓解炎症症状。