治疗肺气肿并没有绝对“最好”的药，需根据病情选择合适药物。一般常用的有支气管舒张剂，像沙丁胺醇气雾剂，能在几分钟内起效，缓解气喘症状；还有糖皮质激素，如布地奈德福莫特罗粉吸入剂，可减轻气道炎症。
支气管舒张剂类药物
β₂受体激动剂： 这类药物能激动气道平滑肌的β₂受体，舒张支气管。像沙丁胺醇，它是短效的β₂受体激动剂，通常能快速缓解喘息等症状，起效时间在几分钟内，但作用维持时间较短，一般4 - 6小时左右。抗胆碱能药物： 代表药物有异丙托溴铵，它通过阻断节后迷走神经通路，降低迷走神经张力而舒张支气管，其起效相对慢一些，大概15 - 30分钟起效，但作用持续时间较长，能维持6 - 8小时。
糖皮质激素类药物
吸入性糖皮质激素： 如布地奈德，它可以减少炎症介质的释放，减轻气道的炎症反应。一般需要规律使用一段时间才能看到较好的效果，通常连续使用1 - 2周后能逐渐改善气道炎症情况。口服糖皮质激素： 对于病情较重的肺气肿患者，可能会短期使用泼尼松等口服糖皮质激素，但长期口服会有较多副作用，像骨质疏松、血糖升高、感染风险增加等，所以一般尽量避免长期口服。
祛痰剂类药物
氨溴索： 它可以增加呼吸道黏膜浆液腺的分泌，减少黏液腺分泌，从而降低痰液黏度，促进肺表面活性物质的分泌，增加支气管纤毛运动，使痰液易于咳出。成人一般可以口服氨溴索片，每次30mg，每天3次。乙酰半胱氨酸： 它能使痰液中的黏蛋白多肽链中的二硫键断裂，降低痰液黏度，适用于浓稠痰液不易咳出的患者，有口服制剂也有雾化剂型，雾化吸入时起效相对快一些。
抗菌药物
当肺气肿患者出现急性加重，有咳嗽、咳痰增多、痰色变黄等细菌感染迹象时，会使用抗菌药物。比如阿莫西林克拉维酸钾，它对多种细菌有抗菌作用，适用于敏感菌引起的呼吸道感染等情况，但使用前需要排除患者是否对青霉素类药物过敏等情况。如果是铜绿假单胞菌等感染风险较高的情况，可能会用到头孢他啶等第三代头孢菌素类药物，但具体使用需根据感染的病原菌及药敏结果来选择。