肠胃炎的药物治疗需根据具体症状来选。一般来说，缓解腹泻可使用蒙脱石散，它能在肠道形成保护膜，帮助止泻，通常成人一次服用1袋（3克），儿童按体重服用。
缓解腹泻类药物：
蒙脱石散： 主要作用是吸附肠道内的病菌和毒素，从而达到止泻的效果。它适合各种原因引起的急、慢性腹泻。不过，服用时要注意用适量温水冲服，且不要与其他药物同时服用，以免影响药效。黄连素片： 对于细菌感染引起的肠胃炎导致的腹泻有一定疗效，它能对抗病原微生物，抑制细菌的生长繁殖。
缓解腹痛类药物：
颠茄片： 能解除胃肠道平滑肌痉挛，缓解腹痛症状。但青光眼患者禁用，因为它会升高眼压。山莨菪碱片： 也可缓解胃肠道平滑肌痉挛引起的疼痛，不过前列腺肥大患者慎用，可能会引起排尿困难。
调节肠道菌群类药物：
双歧杆菌四联活菌片： 含有双歧杆菌、嗜酸乳杆菌等多种有益菌，能调节肠道菌群平衡，改善肠胃炎引起的肠道功能紊乱。服用时要注意用温水送服，避免与抗生素同时服用，否则会影响药效。地衣芽孢杆菌活菌胶囊： 同样是通过补充有益菌来调节肠道菌群，对肠胃炎后肠道菌群失调有很好的调节作用，儿童也可服用，但剂量需遵医嘱。
抑制胃酸分泌类药物：
奥美拉唑肠溶胶囊： 如果肠胃炎伴有胃酸分泌过多，出现烧心、反酸等症状时可使用。它能抑制胃酸分泌的最后一步，从而减少胃酸对胃黏膜的刺激。但长期服用可能会有一些不良反应，如头痛、腹泻等，需在医生指导下使用。雷贝拉唑钠肠溶片： 也是抑制胃酸分泌的药物，作用机制与奥美拉唑类似，适用于胃酸过多引起的肠胃炎相关症状，不过肝功能不全者要慎用。