肾结石的形成与多种因素相关。一般来说，人体尿液中一些物质浓度过高，就容易析出形成结石，比如尿液中钙、草酸、尿酸等成分浓度异常等情况都可能导致肾结石。
代谢异常因素
尿液成分改变： 当尿液中钙、草酸、尿酸、胱氨酸等物质含量过高时，就容易形成结晶，长期积累可能发展成肾结石。例如，尿钙排泄增加是肾结石形成的重要危险因素之一，正常情况下人体尿液中的钙会维持在一定平衡范围，若这个平衡被打破，钙含量异常升高，就为肾结石形成提供了条件。尿酸代谢紊乱： 体内尿酸生成过多或排泄减少，会使尿酸浓度升高，尿酸盐结晶在肾脏沉积，进而形成尿酸结石。比如一些患有痛风的患者，由于尿酸代谢异常，更容易并发尿酸结石。
局部因素
尿路梗阻： 当尿路存在狭窄、肿瘤等情况时，尿液排出受阻，尿液中的晶体物质就容易在局部沉积，从而引发肾结石。像肾盂输尿管连接部狭窄的患者，尿液流通不畅，就比常人更易长肾结石。尿路感染： 泌尿系统发生感染时，细菌、脓块等会作为核心，促使晶体附着沉积，增加肾结石形成的风险。例如膀胱炎患者，如果没有得到及时有效的治疗，炎症可能蔓延影响到肾脏，进而引发肾结石。
生活方式因素
饮水不足： 每天饮水量少于1500毫升时，尿液会浓缩，尿液中晶体物质的浓度相对升高，容易形成结晶，久而久之就可能形成肾结石。比如一些工作繁忙、常常忘记喝水的人，就处于较高的肾结石风险中。饮食不合理： 长期摄入高草酸食物，像菠菜、甜菜、巧克力等，会使体内草酸含量增多，草酸与钙结合形成草酸钙结晶，增加肾结石风险。另外，高嘌呤饮食，如动物内脏、海鲜等，会使尿酸生成增加，也容易诱发尿酸结石。