肝癌可以通过多种检查方法来发现，比如超声检查，它是常用的初筛手段，一般二级以上医院都能开展，价格相对较为亲民，几百元左右。
超声检查
常规超声： 能初步观察肝脏形态、大小以及有无占位性病变等情况，操作比较简便，而且没有辐射。不过对于一些小的肝癌病灶，可能会有漏诊的情况。彩色多普勒超声： 除了能看到肝脏的形态结构，还可以观察肿瘤内部的血流情况，帮助判断肿瘤的血供特点，辅助鉴别肿瘤的性质。
血液检查
甲胎蛋白（AFP）： 这是一种辅助诊断肝癌的重要指标，在大约70%的肝癌患者血清中AFP会升高，但也不是所有肝癌患者AFP都升高，一些孕妇、患有肝炎、肝硬化的人AFP也可能会轻度升高。一般AFP检测值大于400μg/L，持续四周以上，结合影像学检查等可以帮助诊断肝癌。其他肿瘤标志物： 像异常凝血酶原（PIVKA - Ⅱ）、高尔基体蛋白73（GP73）等，也可以作为辅助诊断肝癌的指标，不过单独这些指标异常不能确诊肝癌，需要结合其他检查综合判断。
影像学检查
CT检查： 包括平扫CT和增强CT。增强CT可以更清晰地显示肝脏病灶的大小、形态、数目以及血供情况，对于肝癌的诊断准确率较高。一般能发现1cm左右的肝癌病灶。磁共振成像（MRI）： 对肝癌的诊断价值较高，尤其是对小于1cm的小肝癌以及血管侵犯的显示比CT更敏感。而且MRI没有辐射，对于一些不能做增强CT的患者（如肾功能不全对造影剂过敏等）更适用。
肝穿刺活检
病理检查： 如果通过上述检查高度怀疑肝癌，但又不能完全确诊时，可以考虑肝穿刺活检。通过穿刺获取肝脏组织进行病理检查，这是确诊肝癌的金标准。不过肝穿刺活检是有创检查，存在一定的出血、种植转移等风险，需要严格掌握适应证。