宝宝感染幽门螺旋杆菌后，症状表现多样。部分宝宝可能没有明显症状，而有症状的宝宝常见的有消化不良相关表现，比如食欲减退，有的宝宝吃饭量比平时明显减少；还可能出现上腹部不适，像肚子隐隐作痛，但宝宝可能不太能准确表达，只是表现出哭闹不安等。
消化系统相关症状
腹痛表现： 宝宝可能会说肚子痛，不过位置不太固定，多在上腹部。一般疼痛程度较轻，不会特别剧烈，但会持续或间断出现。恶心呕吐： 有些宝宝会出现恶心的感觉，随后可能发生呕吐，呕吐物多为胃内的容物。
生长发育影响
体重增长缓慢： 如果幽门螺旋杆菌长期感染，影响宝宝的消化吸收功能，可能会导致宝宝体重增长速度比正常情况慢。比如原本应该每几个月体重有明显增加，但是感染后体重增加不明显甚至下降。身高发育受影响： 长期的消化功能紊乱，也可能间接影响宝宝的身高发育，使得身高增长达不到正常的预期水平。
其他可能症状
口腔异味： 宝宝的口腔可能会有异味，像口臭，这是因为幽门螺旋杆菌在胃内代谢产生一些物质，可能通过口腔排出导致。贫血表现： 少数宝宝可能因为长期慢性失血等原因出现贫血，表现为面色苍白、精神萎靡、活动后容易气喘等。