阴道颜色变黑主要与多种生理因素有关。一般来说，女性进入青春期后，体内性激素水平发生变化，雌激素增多会促使黑色素沉积，这是比较常见的原因，通常从十几岁开始逐渐出现变化。
遗传因素影响
个体差异存在： 遗传基因会决定皮肤和黏膜的色素沉着情况。如果家族中女性普遍阴道颜色较深，那么后代女性出现阴道颜色偏黑的概率相对较高。这是因为基因决定了黑色素细胞的活性等相关特性，从遗传角度就奠定了基础。种族遗传差异： 不同种族之间也有差异，比如某些深色人种相对而言阴道颜色变黑的情况可能更为明显，这是由种族的遗传背景所决定的，是长期进化过程中形成的特征。
激素水平变化
青春期发育阶段： 女孩进入青春期后，卵巢开始分泌雌激素，随着雌激素水平逐渐升高，会刺激外阴部的黑色素细胞分泌更多黑色素，导致阴道周围皮肤颜色逐渐加深变黑，这个过程一般在10 - 19岁左右比较明显。孕期激素影响： 女性怀孕后，体内的雌激素和孕激素水平大幅升高，也会促进黑色素沉着，阴道及周围皮肤颜色会进一步加深变黑，一般在孕期3 - 6个月左右就能逐渐观察到变化，分娩后激素水平慢慢恢复，但阴道颜色可能不会完全恢复到孕前状态。
局部摩擦因素
长期穿着紧身衣物： 如果女性长期穿着紧身不透气的内裤或者裤子，会导致阴道部位长期受到摩擦，不断刺激局部皮肤，使得黑色素细胞活跃，进而导致阴道颜色变黑。比如有些女性为了追求身材穿着过紧的牛仔裤等，长时间摩擦就会有影响。性生活影响： 随着性生活的进行，阴道部位会有一定程度的摩擦刺激，而且性生活过程中激素水平也会有变化，长期下来也可能促使阴道局部黑色素沉积增多，使得颜色变黑，一般有规律性生活后几年可能会逐渐体现出这种变化。