疟疾通常会有周期性发作的症状，一般感染疟原虫后，经过10~20天左右的潜伏期就可能发病。
早期症状表现
发冷阶段：患者会突然感觉畏寒，寒战明显，面色苍白，口唇发绀，寒战持续约10分钟~2小时。此时体温开始上升，患者会感觉寒冷。发热阶段：接着体温迅速上升，可达39℃甚至更高，患者出现高热，头痛剧烈、全身酸痛、口渴等症状，发热持续2~6小时左右。
后期症状情况
出汗阶段：之后体温又会突然下降，大量出汗，体温可在数小时内降至正常，出汗后患者感觉身体乏力。然后进入间歇期，间歇时间因疟原虫种类不同而异，间日疟和卵形疟一般间隔48小时发作一次，三日疟间隔72小时发作一次。如果是恶性疟，发热不太规则，可能持续高热，症状相对更严重，还可能出现贫血、黄疸等情况，严重时会影响多个脏器功能。
特殊人群症状特点
儿童患者：儿童感染疟疾后症状可能更不典型，除了发热、寒战等表现外，还可能出现精神萎靡、哭闹不安、食欲不振等情况，有的儿童可能会出现抽搐等神经系统症状，相对成人更容易出现病情加重的情况，需要密切关注。孕妇患者：孕妇患疟疾时，除了自身发热、贫血等常见症状外，还可能对胎儿产生影响，如导致胎儿发育迟缓、早产、低体重儿等，需要及时进行治疗，并且要选择对胎儿相对安全的抗疟药物。