脑干出血多由高血压合并小动脉硬化引起，约70%-80%的脑干出血患者有高血压病史。长期高血压会使脑内小动脉形成微动脉瘤，当血压剧烈波动时，微动脉瘤破裂就会导致脑干出血。
高血压因素：
血压长期控制不佳： 高血压患者如果血压长期处于较高水平，如收缩压持续高于140mmHg，舒张压持续高于90mmHg，且没有得到有效的药物控制和生活方式干预，就容易引发脑干血管病变，增加脑干出血风险。据统计，高血压患者发生脑干出血的几率比血压正常者高很多倍。血压突然剧烈升高： 比如在情绪激动、剧烈运动、用力排便等情况下，血压会急剧上升，这会对脆弱的脑干血管造成极大压力，从而导致血管破裂出血。例如，一些人在暴怒后可能会突然发生脑干出血。
血管病变因素：
脑内小动脉硬化： 长期高血压会使脑内小动脉管壁增厚、变硬，管腔狭窄，血管弹性减退。随着时间推移，血管壁会变得脆弱，容易破裂出血。这种小动脉硬化在脑内广泛存在时，就可能累及脑干血管，引发脑干出血。动脉瘤形成： 高血压引起的血流冲击等因素可能导致脑内小动脉局部膨出形成动脉瘤，脑干部位的小动脉瘤同样存在破裂出血的风险。一旦动脉瘤破裂，血液就会涌入脑干，造成脑干出血。
其他相关因素：
年龄因素： 中老年人更容易发生脑干出血，因为随着年龄增长，血管弹性下降，高血压等血管性疾病的发生率升高。一般来说，50-70岁是脑干出血的高发年龄段。不良生活习惯： 长期大量吸烟、酗酒也会增加脑干出血的风险。吸烟会使血管收缩、血压升高，还会损伤血管内皮；酗酒会使血压波动，加重血管病变，进而容易诱发脑干出血。例如，每天大量吸烟的人比不吸烟的人患脑干出血的可能性要高不少。