舌根两边疼可能是多种原因引起的，以下是一些可能的原因：
1.感染：喉咙或口腔的感染，如扁桃体炎、咽炎等，可能导致舌根两边疼痛。
2.溃疡：口腔溃疡或口腔黏膜破损也可能引起舌根两边的疼痛。
3.过敏：对某些食物、药物或口腔清洁用品过敏，可能导致舌根两边的疼痛和肿胀。
4.损伤：咬伤、烫伤或过度使用舌头等可能导致舌根两边的损伤和疼痛。
5.口腔疾病：牙龈炎、牙周炎等口腔疾病也可能引起舌根两边的疼痛。
6.全身性疾病：某些全身性疾病，如糖尿病、贫血等，可能导致口腔症状，包括舌根两边的疼痛。
7.神经痛：舌咽神经痛等神经病变可能引起舌根两边的阵发性疼痛。
8.其他原因：舌根两边的肿瘤、囊肿等也可能导致疼痛。
如果舌根两边的疼痛持续时间较长、严重影响生活或伴有其他症状，如发热、吞咽困难、呼吸困难等，应及时就医。医生会进行详细的口腔检查、询问病史，并可能进行进一步的检查，如血液检查、影像学检查等，以确定疼痛的原因并给予适当的治疗。
在等待就医期间，可以尝试以下方法缓解疼痛：
1.保持口腔清洁，使用温盐水漱口。
2.避免食用辛辣、刺激性食物和酸性饮料。
3.避免过度使用舌头，尽量减少说话。
4.保持充足的水分摄入。
5.按照医生的建议使用止痛药。
需要注意的是，对于舌根两边疼的原因和治疗，个体差异较大，因此最好在医生的指导下进行诊断和治疗。