男人肚子两侧疼可能由多种原因引起，比如泌尿系统结石，其中输尿管结石较为常见，约占尿路结石的60%左右。
泌尿系统疾病方面
输尿管结石：
输尿管结石会导致肚子两侧疼，通常疼痛较为剧烈，呈绞痛样，还可能伴有血尿，部分人会出现恶心、呕吐等症状。如果结石较小，有可能自行排出体外，但一般建议大量饮水，每天饮水量最好在2000毫升以上，以促进结石排出。
前列腺炎：
成年男性较为常见，除了肚子两侧疼，还可能出现尿频、尿急、尿不尽等排尿异常症状，部分人会有会阴部坠胀感。慢性前列腺炎治疗周期相对较长，需要注意避免久坐、饮酒、吃辛辣食物等，以免加重症状。
消化系统疾病方面
结肠疾病：
如结肠炎，可能由细菌感染、自身免疫等因素引起，除了肚子两侧疼，还可能伴有腹泻、黏液便等症状。如果是细菌感染导致的结肠炎，需要根据病情考虑使用抗生素治疗，但要在医生指导下用药。同时要注意饮食卫生，避免食用不洁食物。
肠道痉挛：
多由饮食不当引起，比如吃了过多生冷、刺激性食物。疼痛一般为阵发性，可自行缓解。可以通过热敷肚子两侧来缓解痉挛，同时要注意调整饮食，避免再次食用刺激性食物。
肌肉骨骼方面
肌肉拉伤：
如果近期进行了剧烈运动，如仰卧起坐、俯卧撑等，可能导致肚子两侧的肌肉拉伤，从而引起疼痛。拉伤后要注意休息，在受伤24小时内可以进行冷敷，减轻肿胀和疼痛，24小时后可以热敷，促进血液循环。总之，男人肚子两侧疼的原因较多，需要结合具体症状、体征以及相关检查来明确病因。如果肚子两侧疼痛持续不缓解或伴有其他严重症状，如大量肉眼血尿、剧烈呕吐不止等，应及时就医，进行详细检查，以便针对性治疗。