手足口病目前没有特效的抗病毒药物，主要是对症治疗。一般来说，可使用一些缓解症状的药物。比如，当患儿发热时，若体温超过38.5℃，可以考虑使用对乙酰氨基酚等退烧药来帮助降温，但具体用药需谨慎，尤其要注意儿童的年龄等因素。
对症治疗药物种类
退热药物：
对乙酰氨基酚： 适用于6个月以上的儿童，能通过抑制前列腺素合成发挥解热镇痛作用，帮助降低体温，缓解发热带来的不适。不过，使用时要严格按照儿童体重等计算合适剂量。布洛芬： 适合6个月以上儿童，它通过抑制环氧化酶活性，减少前列腺素合成，从而起到解热、镇痛、抗炎作用。但要注意，严重肝肾功能不全者等需慎用。
缓解口腔症状药物：
重组人干扰素α： 可喷雾或雾化使用，能抑制病毒复制，起到一定的抗病毒作用，有助于减轻口腔内疱疹引起的炎症等情况。一般是根据患儿年龄等调整使用剂量和频率。康复新液： 含多种氨基酸、多元醇类和肽类物质，能促进黏膜修复。可用于漱口等，帮助减轻口腔疱疹破溃后的疼痛，促进创面愈合，但使用时要注意让患儿正确含漱等。
其他对症药物：
蒙脱石散： 若患儿伴有腹泻症状，蒙脱石散可以吸附肠道内的病毒、细菌等病原体及其产生的毒素，保护肠道黏膜，起到止泻作用。服用时要注意用适量温水冲服，且和其他药物间隔一段时间。需要注意的是，手足口病大多为自限性疾病，病程一般在1周左右。在用药过程中，要密切观察患儿病情变化，如果症状持续不缓解或加重，如出现精神差、嗜睡、抽搐等情况，应及时就医，由医生根据具体情况调整治疗方案，家长切勿自行随意给患儿滥用药物。同时，要让患儿多休息，多饮水，保持口腔清洁等一般护理也很重要。