两只眼睛不能聚焦，原因主要有以下这些：
一、视疲劳：如果长期熬夜、过度使用电子屏幕以及用眼过度，就可能引发视疲劳，进而使睫状肌功能减弱，调节力下降，导致眼睛出现短暂性的不聚焦。
1.长期熬夜会打乱人体的生物钟，影响眼睛的正常休息和恢复。
2.电子屏幕发出的蓝光等对眼睛会产生不良影响，长时间使用容易使眼睛疲劳。
3.过度用眼会让睫状肌一直处于紧张状态，时间久了功能就会减退。
二、中老年人老花眼：老化因素致使睫状肌松弛退化、晶状体弹性降低，调节力下降，从而引起眼睛聚焦困难，其特点是难以聚焦在近处物体上，但聚焦远处物体不受影响。
三、斜视问题：比如麻痹性斜视、急性共同性斜视或限制性斜视等情况，会让双眼的运动不协调，无法将视线汇聚在同一物体上，进而造成无法聚焦。
1.麻痹性斜视是由于神经或肌肉问题导致的。
2.急性共同性斜视会突然出现双眼不能协调聚焦。
3.限制性斜视可能由于眼眶或眼部其他结构异常引起。
四、屈光不正：当眼睛角膜或晶状体出现异常，导致光线不能正确折射，形成近视、远视、散光等屈光不正情况，这都可能引起眼睛不聚焦、视野模糊、重影以及视力下降等。
1.近视是看不清远处物体。
2.远视是难以看清近处物体。
3.散光则会使物体成像变得模糊和扭曲。
五、睫状肌麻痹：通常是动眼神经出现损伤引起的，使得睫状肌的调节功能减退或丧失，进而导致眼睛无法聚焦。
六、屈光参差：如果两只眼睛的屈光度数差别较大，物体光线经过眼睛折射后所形成的物像大小不一，大脑无法将其充分融合，因此会出现聚焦困难的症状。
建议患者一旦出现眼睛不能聚焦的情况，尽快到医院就诊，查明具体病因，并进行对症治疗。