偏头痛引起眼睛痛，主要是因为头部的神经与眼部神经有一定关联。大约有三分之一的偏头痛患者在发作时会出现眼部症状，比如眼睛痛。
神经传导关联
偏头痛发作时，颅内的血管会发生扩张或收缩异常，而眼部周围的神经与颅内神经是相通的，血管的异常变化会影响到眼部神经，从而引发眼睛痛。这种神经传导上的关联使得偏头痛的疼痛感觉能够波及到眼睛部位。
血管因素影响
偏头痛发作时，头部血管舒缩功能紊乱。眼部周围也有丰富的血管分布，当头部血管出现异常变化时，眼部血管也会受到牵连。例如，头部血管扩张可能会压迫到眼部的神经和血管，导致眼睛出现胀痛、刺痛等不适感觉。一般来说，偏头痛发作时眼睛痛的程度和头部偏头痛的程度往往有一定相关性，头部疼痛越剧烈，眼睛痛可能也越明显。
炎症介质作用
偏头痛发作时，体内会释放一些炎症介质，如前列腺素等。这些炎症介质不仅会导致头部疼痛，还可能影响到眼部组织。它们会刺激眼部的神经末梢，引起眼睛部位的疼痛、畏光等症状。而且，炎症介质的作用会持续一定时间，在偏头痛发作期间，眼睛痛可能会伴随偏头痛持续存在或者在偏头痛缓解后仍有短暂的残留。
眼部肌肉反应
偏头痛发作时，头部的肌肉可能会出现紧张收缩的情况，这种紧张也会波及到眼部周围的肌肉。眼部肌肉的紧张会影响到眼睛的正常状态，进而引发眼睛痛。比如，眼部周围的眼轮匝肌等肌肉紧张，会导致眼睛有紧绷感、疼痛感等。长时间的偏头痛发作可能会让这种眼部肌肉的紧张状态更加明显，加重眼睛痛的程度。