睡醒肩膀脖子很酸痛一般与以下原因有关：
一、睡姿不正确：睡觉期间姿势不佳，比如侧卧位睡，会致使肩膀部位的肌肉、韧带长时间受压，进而容易引发酸痛感。对此，可通过改善不良睡姿，同时对局部进行按摩、热敷等方式来缓解，通常能取得较好效果。
二、受凉：睡觉时肩膀部位保暖措施不到位，局部受到冷空气侵袭，会影响正常血液运行，导致出现痉挛性疼痛。这种情况下，采用热水袋对局部进行热敷，有利于加快血液循环，有助于症状的改善。
三、落枕：睡觉时枕头过高或过硬，使得颈部长期处于过伸或过屈状态，容易拉伸颈部一侧的肌肉、韧带，从而诱发落枕，其典型症状表现为上背部、肩膀部疼痛，同时伴有颈部活动受限。若疼痛持续不缓解，可在医生指导下口服美洛昔康胶囊、塞来昔布胶囊、布洛芬缓释胶囊等药物，这些药物具有消炎、镇痛、缓解肿胀的作用。
此外，如果本身患有颈椎病、肩周炎、骨质增生等疾病，也可能出现这种症状。对于反复出现该情况者，可前往医院骨科就诊，由专业医生进行明确诊断。
总之，睡醒后肩膀脖子酸痛可能由多种原因引起，要根据具体情况采取相应的措施进行处理。如果症状持续不缓解或加重，应及时就医。