耳朵里面会不时的隐隐作痛，可能是以下原因引起：
1.外耳道炎：外耳道皮肤外伤或局部抵抗力降低时易发病，如挖耳、游泳时耳朵进水等。此外，化脓性中耳炎的脓液刺激，以及糖尿病等疾病也可诱发外耳道炎。外耳道炎除了会导致耳朵里面隐隐作痛外，还可能伴有外耳道皮肤红肿、局部有分泌物等症状。
2.中耳炎：中耳炎是累及中耳（包括咽鼓管、鼓室、鼓窦及乳突气房）全部或部分结构的炎性病变，好发于儿童。中耳炎可分为分泌性中耳炎和化脓性中耳炎，两种类型的中耳炎均可导致耳朵疼痛，多为耳部深处或头部，有时还会伴有听力下降、耳鸣等症状。
3.耵聍栓塞：耵聍俗称耳屎，是外耳道软骨部上的耵聍腺分泌的淡黄色黏稠液体。耵聍栓塞是指耵聍在外耳道内聚集成团，阻塞外耳道。耵聍栓塞可能会导致患者出现听力下降、耳痛、耳鸣等症状。
4.耳部肿瘤：耳部的恶性肿瘤相对较为少见，可发生于耳廓、外耳道、中耳和内耳等部位。早期常表现为耳部的间歇性隐痛或胀痛，如果肿瘤侵犯周围组织或神经，还可能出现面瘫、听力下降、眩晕等症状。
5.其他：除了上述疾病外，神经痛、三叉神经痛、舌咽神经痛等也可导致耳朵里面疼痛。此外，高血压、颈椎病等疾病也可能引起放射性耳痛。
如果出现耳朵里面不时隐隐作痛的情况，建议及时就医，明确病因，以便进行针对性的治疗。在就医前，应避免自行掏耳，以免加重病情。同时，应注意保持耳部清洁，避免水进入耳道。如果疼痛严重，可在医生的指导下使用止痛药缓解症状。