根据你所提供的信息，可能是由于以下原因引起的：
痤疮：痤疮是一种常见的慢性炎症性皮肤病，好发于青少年的面部、背部和胸部等部位。痤疮的发生与多种因素有关，如皮脂腺分泌过多、毛囊口角化、痤疮丙酸杆菌感染、炎症反应等。
马拉色菌毛囊炎：马拉色菌毛囊炎是由马拉色菌感染引起的一种皮肤病，好发于青壮年的颈部、前胸、后背等部位。马拉色菌毛囊炎的发生与多汗、油脂分泌过多、使用糖皮质激素等因素有关。
其他：除了上述两种疾病外，肩膀两边长痘痘还可能与其他因素有关，如过敏、感染、内分泌失调等。
需要注意的是，以上只是一些可能的原因，具体原因需要根据个人的具体情况进行分析。如果你肩膀两边长了好多痘痘，建议及时就医，以便明确诊断并采取相应的治疗措施。在就医之前，应避免搔抓、挤压痘痘，以免加重病情。
此外，对于特殊人群，如孕妇、哺乳期妇女、儿童等，在使用药物治疗时需要特别注意，应在医生的指导下使用安全的药物。同时，应注意保持皮肤清洁，避免使用刺激性的化妆品和护肤品，避免食用辛辣、油腻等食物，以有助于病情的恢复。