小便时尿道刺痛可能是尿道炎、前列腺炎等疾病引起的，需要根据具体病因选择合适的药物治疗，以下是一些常用的药物：
1.抗生素：如果是细菌感染引起的尿道炎、前列腺炎等疾病，可使用抗生素进行治疗，如头孢呋辛酯、左氧氟沙星等。这些药物可以抑制细菌的生长和繁殖，缓解尿道刺痛等症状。
2.非甾体抗炎药：如果是前列腺炎引起的尿道刺痛，可使用非甾体抗炎药进行治疗，如布洛芬、对乙酰氨基酚等。这些药物可以缓解炎症反应，减轻尿道刺痛等症状。
3.α受体阻滞剂：如果是前列腺增生引起的尿道刺痛，可使用α受体阻滞剂进行治疗，如特拉唑嗪、多沙唑嗪等。这些药物可以松弛尿道平滑肌，缓解尿道梗阻，减轻尿道刺痛等症状。
4.中成药：如果是慢性前列腺炎引起的尿道刺痛，可使用一些中成药进行治疗，如前列舒通胶囊、前列回春胶囊等。这些药物可以活血化瘀、清热利湿，缓解尿道刺痛等症状。
需要注意的是，尿道刺痛的病因较为复杂，需要在医生的指导下进行治疗。同时，在治疗过程中，应注意个人卫生，多喝水，避免憋尿，少吃辛辣刺激性食物，有助于病情的恢复。