小便时尿道刺痛可能由多种原因引起，如尿道炎、膀胱炎等。如果是细菌感染导致的尿道炎或膀胱炎引起的尿道刺痛，常用的药物有以下几类：
抗生素类药物
喹诺酮类：如诺氟沙星，对革兰阴性菌有较好的抗菌作用，可用于治疗敏感菌引起的尿道感染。但18岁以下未成年人禁用，因为可能影响软骨发育。
头孢菌素类：例如头孢克肟，对多种细菌有抗菌活性，对于尿道感染也有一定的疗效。孕妇及哺乳期妇女需谨慎使用，应在医生评估利弊后决定是否使用。
中成药
清热通淋类：比如三金片，具有清热解毒、利湿通淋的作用，可辅助缓解尿道刺痛等症状。孕妇禁用，服药期间忌烟、酒及辛辣食物。
引起小便时尿道刺痛的原因较多，在用药前首先需要明确病因。建议及时就医，进行尿常规、尿培养等检查，由医生根据具体的病因和病情来选择合适的药物，不建议自行盲目用药。同时，患病期间要注意多饮水，增加尿量，起到冲刷尿道的作用，有助于缓解症状，并且要注意个人卫生，保持局部清洁。