萎缩性胃炎癌变几率总体较低，但不同情况有所差异。一般而言，单纯萎缩性胃炎癌变几率约为1%左右，但存在多种影响因素会改变这一几率。
与幽门螺杆菌感染相关的情况
若萎缩性胃炎伴有幽门螺杆菌感染，会增加癌变风险。幽门螺杆菌长期刺激胃黏膜，可导致炎症持续损伤，使癌变几率较无幽门螺杆菌感染的萎缩性胃炎有所升高，但具体升高幅度因个体差异等因素有所不同。
与肠上皮化生情况相关的情况
当萎缩性胃炎伴有肠上皮化生时，癌变几率会相应增加。肠上皮化生是胃黏膜上皮被肠型上皮细胞替代的现象，中重度肠上皮化生者癌变风险相对更高。
与异型增生情况相关的情况
出现异型增生时，癌变几率明显上升。轻度异型增生者癌变几率相对稍低，而中重度异型增生已被视为癌前病变，癌变可能性大幅提高。
特殊人群需特别关注
对于老年萎缩性胃炎患者、有长期不良生活方式（如长期吸烟、酗酒、高盐饮食等）的萎缩性胃炎患者以及有家族胃癌病史的萎缩性胃炎患者，更要密切关注病情，因为这些特殊人群癌变几率可能相对更高，需定期进行胃镜等检查以便早期发现异常。