牙齿最里面的肉痛肿可能由以下原因引起：
1.智齿冠周炎：智齿是口腔内牙槽骨上最里面的第三颗磨牙，由于萌出空间不足，智齿可能无法完全萌出，部分牙龈覆盖在牙齿表面，形成盲袋，容易积存食物残渣和细菌。当身体抵抗力下降时，细菌就会繁殖并引起炎症，导致牙龈肿痛。在炎症初期，患者仅会感觉牙龈局部胀痛不适，当病情进一步发展，会出现局部自发性跳痛，甚至张口受限、吞咽困难等症状。
2.牙周炎：牙周炎是侵犯牙龈和牙周组织的慢性炎症，是一种破坏性疾病，主要由局部因素引起，如菌斑、牙石、食物嵌塞、不良修复体、咬创伤等。牙龈肿痛是牙周炎的常见症状之一，此外，患者还会出现牙龈出血、口臭、牙齿松动等症状。
3.根尖周炎：根尖周炎是指发生在牙根尖周围组织的炎症性疾病，多由牙髓病继发而来。当牙髓发生炎症后，若未得到及时治疗，炎症可向牙根尖周围组织扩散，形成根尖周炎。根尖周炎的主要症状为牙齿疼痛，初期疼痛为阵发性、自发性疼痛，且疼痛范围局限，通常可定位患牙。当炎症进一步发展，疼痛可逐渐加重，呈持续性、搏动性疼痛，并向同侧头面部放射。此外，患者还会出现患牙咬合痛、牙龈肿胀等症状。
4.牙龈乳头炎：牙龈乳头炎是指局限于牙龈乳头的炎症，多由局部刺激因素引起，如食物嵌塞、不恰当的剔牙、过硬过锐的食物刺伤等。牙龈乳头炎的主要症状为牙龈乳头红肿、疼痛，探诊和吸吮时易出血。
针对牙龈肿痛的治疗，可在医生的指导下使用以下药物：
1.抗生素：如甲硝唑、阿莫西林等，可有效控制炎症。
2.止痛药：如布洛芬、对乙酰氨基酚等，可缓解疼痛症状。
3.漱口液：如复方氯己定含漱液、康复新液等，可保持口腔清洁，减轻炎症。
此外，在日常生活中，应注意保持口腔清洁，早晚刷牙，饭后漱口，可有效预防牙龈肿痛的发生。如果牙龈肿痛症状持续不缓解或加重，建议及时就医，明确病因，并进行针对性治疗。