撒尿时阴茎疼痛可能由以下原因引起：
1.尿道炎：由细菌、病毒等感染引起，除疼痛外，还可能伴有尿频、尿急、尿道口红肿等症状。可遵医嘱使用抗生素治疗，如左氧氟沙星、阿莫西林等。
2.前列腺炎：常见于中青年男性，可由细菌感染或前列腺充血引起，疼痛可放射至阴茎。治疗方法包括药物治疗（如前列康、前列舒通等）、物理治疗（如微波、射频等）和手术治疗（如前列腺电切术等）。
3.阴茎外伤：如骑跨伤、性交过度等，可导致阴茎损伤，引起疼痛。治疗方法取决于损伤的严重程度，轻微损伤可自行愈合，严重损伤可能需要手术修复。
4.其他：包茎、包皮过长、尿道结石等也可能导致撒尿时阴茎疼痛。
如果出现撒尿时阴茎疼痛的症状，建议及时就医，进行相关检查，如尿常规、前列腺液检查、超声等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，应注意个人卫生，保持尿道口清洁，避免过度性生活和憋尿。